萌学园，一所由夸克族人组成的魔法学校，隐藏在地球大气层外平行空间里，以萌骑士为首，世世代代守护地球。在一次抢救魔法生物的任务中，意外引来宇宙中的黑色力量莫尔斯，以摧毁地球威胁萌骑士交出磐古，因此揭开了埋在地球深处的秘密。